分公司是否单独做账报税，主要看分公司是否进行独立核算。
分公司不是独立的法人，分公司的资金和业务等受总公司管理和控制。但如果分公司独立核算的，则可以单独报税。如果不是独立核算的，则由总公司报税。公司的下属分支机构缴纳所得都有两种形式：一是独立申报纳税；一是合并到总公司汇总纳税。
补充：总分公司独立核算和非独立核算如何理解？
独立核算主要是指对本单位的业务经营活动过程及其成果进行全面、系统的会计核算。
非独立核算一般是因为没有资本，所以财产物资是由上级单位进行拨付的，因为没有独立的银行账户，所以它的所有收入都要存入到上级单位账户，支出也由上级单位审核通过后再进行支付。
若在公司所在地有流转税纳税义务，那分公司就需要登记为独立核算性质的分公司。在当地不从事生产经营活动，只负责联络、售后服务等于经营相关的业务，而且在当地也不需要进行流转税的缴纳，那么需要登记为非独立核算性质的分公司。
总的来讲，无论分公司是否采用独立核算，都要根据要求单独建账。独立核算和非独立核算的主要区别在于采用非独立核算的分公司，它的一切账务是需要汇总到总公司进行核算的。
