民航局直属高校共有4所，分别为中国民航大学、中国民用航空飞行学院、上海民航职业技术学院、广州民航职业技术学院。
| 序号 | 学校名称 | 主管部门 | 所在地 | 层次 | 备注 |
| 1 | 中国民航大学 | 交通运输部（中国民用航空局） | 天津 | 本科 | 公办 |
| 2 | 中国民用航空飞行学院 | 交通运输部（中国民用航空局） | 四川德阳 | 本科 | 公办 |
| 3 | 上海民航职业技术学院 | 交通运输部（中国民用航空局） | 上海 | 专科 | 公办 |
| 4 | 广州民航职业技术学院 | 交通运输部（中国民用航空局） | 广东广州 | 专科 | 公办 |
中国民航大学简介：
中国民航大学（Civil Aviation University of China）是中国民用航空局直属的一所以培养民航高级工程技术和管理人才为主的高等学府，是中国民用航空局、天津市人民政府、教育部共建高校，是教育部第二批“卓越工程师教育培养计划”高校、天津市高水平特色大学建设高校，首批入选国家级大学生创新创业训练计划、国家级新工科研究与实践项目，国际航空认证委员会教育会员，国际民航组织升级版航空培训计划正式会员，CDIO工程教育联盟成员单位，具有推荐优秀应届本科毕业生免试攻读研究生资格高校。中国民航大学前身是1951年9月成立的军委民航局第二民用航空学校，1956年更名为中国人民解放军第十四航校，1958年更名为中国民用航空高级航空学校，1963年重组为中国民用航空机械专科学校，1977年更名为中国民用航空专科学校，1981年更名为中国民用航空学院，2006年5月30日，更名为中国民航大学。
中国民用航空飞行学院简介：
中国民用航空飞行学院简称中飞院（CAFUC），位于四川省广汉市，是中央部属高校，由中国民用航空局直属，入选联合国重点推广的“MPL”课程试点单位、四川省“双一流”建设计划。是全球办学规模最大的飞行培训机构，是世界上规模最大的以飞行训练为主的学校，建校以来，中飞院已为中国民航培养了70%的飞行员、80%的机长、90%的功勋飞行员和100%的特级飞行员，被誉为中国民航飞行员的“摇篮”、中国民航管理干部的“黄埔”。前身是创建于1956年的中国民用航空局航空学校，同年9月，更名为中国人民解放军第十四航空学校，后又以中国民用航空高级航校、中国民用航空飞行专科学校为校名。1987年11月，升格为本科院校，更名为中国民用航空飞行学院。