南通大学拥有多个专业，其中包括但不限于以下王牌专业：
机械工程及自动化
自动化
电子信息工程
计算机科学与技术
临床医学
护理学
小学教育
汉语言文学
海洋工程
电子商务
思想政治教育
历史学
教育技术学
纺织工程
土木工程
环境科学
材料科学与工程
能源与动力工程
化学工程与技术
建筑学
请注意，专业设置可能会发生变动，建议以南通大学最新公布的数据为准。
