中央大学南京四牌楼旧址现已开发为中央大学历史风貌区，主要包括现东南大学四牌楼校区和现南京师范大学附属小学。1991年，南京国立中央大学建筑群被国家建设部、国家文物局评为近代优秀建筑，1992年被列为南京市文物保护单位。2006年，国立中央大学旧址被国务院列为全国重点文物保护单位。现保留的建筑有校园南大门、大礼堂、生物馆、牙科医院等。这些建筑，基本上呈对称布局，从南大门至大礼堂形成一条中轴线，其他的建筑物依次排列在中轴线的两侧。
中央大学重庆旧址主要位于重庆沙坪坝(抗战时期主校区)、柏溪(一二年级新生校区)等地。保存建筑有:原中央大学大礼堂、七七抗战大礼堂遗址等。
