上海海洋大学前身，可以追溯到1912年成立的江苏省立水产学校。1904年，为抵御侵渔、维护海权，著名实业家、教育家张謇主张“渔权即海权”，向清廷倡议创办水产学校。后经黄炎培襄助和首任校长张镠竭力筹措，于1912年正式创办，系我国最早的水产学校之一。
1927年，学校更名为第四中山大学农学院水产学校，1928年更名为国立中央大学农学院水产学校，1929年恢复江苏省立水产学校校名。1937年因八一三淞沪抗战，校舍毁于战火，辗转四川合川艰难维续水产教育。1939年先于国立第二中学成立水产部，后于1943年成立国立四川水产职业学校。1947年在上海复校，定名为上海市立吴淞水产专科学校，1951年更名为上海水产专科学校，1952年组建升格为上海水产学院，成为中国第一所本科建制的高等水产学府。1972年受“文化大革命”影响搬迁到厦门集美办学，更名为厦门水产学院，1979年迁回上海原址恢复上海水产学院，同时保留厦门水产学院。1985年更名为上海水产大学。2008年为适应国家海洋事业发展需要，更名为上海海洋大学。
