代扣代缴个税手续费返还需要缴纳增值税。
一、收到代扣代缴个人所得税的手续费返还按照“商务辅助服务---经纪代理服务”缴纳增值税。一般纳税人税率为6%，小规模纳税人征收率为3%。
二、城建税、附加税：根据实际缴纳的流转税计算相应的城建税（7%、5%、1%）及教育费附加（3%）、地方教育费附加（2%）；
三、收到“三代”手续费返还，需要并入企业的收入总额，参与企业所得税的计算。
小规模纳税人申报缴纳城市维护建设税、教育费附加、地方教育附加时，按各地要求在50%幅度内减征税额。
补充：什么是“三代”手续费？
"三代"手续费是指：代扣代缴、代收代缴和委托代征税款。
代扣代缴个税手续费主要就是企业代员工扣个人所得税，代为上缴税务局的一种行为。
