这种操作不违规。是先付款还是先开票，由双方的合同约定，属于民事范围。只要双方同意，签字盖章，就有法律效益，可以先开票后付款，也可以先付款后开票。
不过增值税上要注意：
1、销售货物还未收款就开具发票，已确认纳税义务发生，需要申报缴纳增值税。
依据中华人民共和国增值税暂行条例实施细则(财政部 国家税务总局令第50号)
2、填开发票的单位和个人必须在发生经营业务确认营业收入时开具发票。未发生经营业务一律不准开具发票。
依据中华人民共和国发票管理办法实施细则(国家税务总局令第25号)。
