建筑行业资质证书的办理部门是市建设局、省建设厅和国家住建部，这几个建设主管部门审批办理的是逐级上升的，市建设局是办理最低等级资质，国家住建部是申报特级资质和一些特别的资质证书。
1、当建筑企业想要办理三级专包资质或三级总包资质时，企业所在地的住建局可直接审批;
2、如省住建厅，属于省级住建主管部门，主要审批专包一、二级资质和总包二级资质，值得注意的是：铁路专包三级资质和通信、铁路总包三级资质也是由住建厅审批办理，而铁路、民航的二级专包资质和公路、水利、铁路等一级专包资质需由住建部许可;
3、住建部是直属国务院下，审批权限最高的住建部门，特级资质、一级总包资质、个别特殊一、二级专包资质都是由住建部审批的;在资质审批权下放后，住建部将部分审批权限赋予试点的住建厅。除最高等级资质和需跨部门审批的资质以外，将受理和审批原由住房和城乡建设部负责审批的建设工程企业资质审批事项。
